1.一些代理记账公司没有与委托单位签订正式的委托代理合同，对双方的权利、义务缺少明确的规定。如果在实际的工作中碰到问题时，往往无法分清责任。因此在选择代账公司的时候，企业就要更加谨慎。

2.有些代理记账公司没有代理记账资质，代理记账资质包括代理记账许可证、会计证等。如果发生问题可以回避责任，损害委托单位的利益。这也是小企业在选择代账服务公司时必须要注意的事项。

3.财务软件需要到财政局备案方可使用，有的代理记账单位没有采用财政部批准的财务软件来替代手工记账。

4.会计资料交接麻烦、不够规范。代理记账公司在接受委托单位的会计原始凭证及资料时，没有办理交接手续，发现遗失或毁损时无法查找。

选择代理记账，其实是有很多好处的。例如：

1.节省费用，享用专业团队的服务。

2.运用财务软件做账，高效，低差错率。

3.一站式服务，免除企业后顾之忧。

4.避免因会计人员变动造成企业不必要的经济损失。

5.避免专职会计技能单一，影响会计质量。